A Associação Paulista de Medicina de São José dos Campos foi fundada em 24 de fevereiro de 1954, por 35 médicos, a maioria deles tisiologistas que atendiam nos sanatórios para tuberculosos.
O primeiro presidente da entidade foi João Batista de Souza Soares. As primeiras reuniões, palestras e eventos promovidos pela APM São José dos Campos eram realizados no auditório da Faculdade de Direito ou na Santa Casa de Misericórdia.
Em dezembro de 1968, foi inaugurada a Casa do Médico, na Av. São José, sob a presidência de Antonio Mazzuco. O terreno havia sido doado pela Prefeitura Municipal na gestão de Carlos Alberto Martins na APM e os recursos para a construção da sede vieram do Departamento Previdenciário da APM São Paulo (70%) e das contribuições dos associados de São José dos Campos (30%).
Em agosto de 1999, a Casa do Médico foi reformada e ampliada, recebendo novos pisos, telhados e rede elétrica e hidráulica. O estacionamento foi pavimentado e o andar superior recebeu dois banheiros e uma cozinha, transformando-se em um local para eventos culturais, congressos, cursos, palestras e reuniões.
Um painel do artista plástico George Rembrandt Gutlich, de São José dos Campos, doado pelo Serviço de Hematologia do Vale do Paraíba, foi colocado na parede de entrada.
Em abril de 2001, o auditório da Casa do Médico foi denominado Auditório Dr. Antonio Mazzuco, em homenagem ao médico e ex-presidente da APM Regional em cuja gestão foi construída a sede da entidade.
Em outubro de 2017 a Casa do Médico recebeu nova pintura e obras de alteração do portão do estacionamento. Com o objetivo de tornar mais segura a entrada dos veículos na sede da APM Regional, o portão foi deslocado da rua Rui Dória para a via lateral, que dá acesso à avenida Madre Tereza.