A Regional de São José dos Campos da Associação Paulista de Medicina foi fundada em 24 de fevereiro de 1954, por 35 médicos, a maioria deles tisiologistas que atendiam nos sanatórios para tuberculosos.
O primeiro presidente da entidade foi João Batista de Souza Soares. As primeiras reuniões, palestras e eventos promovidos pela APM Regional eram realizados no auditório da Faculdade de Direito ou na Santa Casa de Misericórida.

Em dezembro de 1968, foi inaugurada a Casa do Médico, na Av. São José, sob a presidência de Antonio Mazzuco. O terreno foi doado pela Prefeitura Municipal na gestão de Carlos Alberto Martins e os recursos para a construção da sede vieram do Departamento Previdenciário da APM (70%) e das contribuições dos associados de São José dos Campos (30%).